Comparatif · Mis à jour 2026

Les meilleurs logiciels
de facturation e-commerce
en 2026

Nous avons comparé tous les logiciels de facturation qui se connectent à Order Invoicer — pour choisir le bon outil pour votre boutique en ligne et automatiser votre facturation.

Pourquoi c’est important

Le bon logiciel de facturation fait gagner des heures

Chaque vente en ligne nécessite une facture conforme — mais le meilleur logiciel dépend de votre taille, de votre organisation comptable et de votre façon de vendre. Nous avons comparé les logiciels de facturation qui se connectent à Order Invoicer pour vous aider à choisir en confiance.

Quel que soit votre choix, Order Invoicer synchronise automatiquement vos commandes Shopify, WooCommerce, PrestaShop, Amazon et autres : factures, avoirs et clients, sans export manuel.

  • La ressaisie manuelle des commandes e-commerce coûte des heures chaque semaine.
  • Les erreurs de TVA, d’avoirs ou de numérotation créent un risque de conformité.
  • Le bon outil, connecté à votre boutique, rend la facturation automatique et prête pour un contrôle.
En un coup d’œil

Logiciels de facturation comparés

Tous se synchronisent nativement avec vos commandes e-commerce via Order Invoicer.

OutilIdéal pourÀ partir deRéforme 2026Order Invoicer
PennylanePennylaneMarques en croissance qui veulent une comptabilité en temps réel et la facturation.À partir de 29 €/moisCandidat PDP enregistréNatif
SellsySellsyMarques qui ont besoin de CRM, devis et facturation dans un seul outil.À partir de 29 €/utilisateur/moisCandidat PDPNatif
QontoQontoFondateurs qui veulent banque et facturation réunies.À partir de 9 €/moisCompatible Factur-XNatif
AbbyAbbyAuto-entrepreneurs qui vendent en ligne.Offre gratuite, Pro à partir de 11 €/moisCompatible Factur-XNatif
AxonautAxonautPetites équipes qui veulent un seul outil pour tout.À partir de 42 €/moisCompatible Factur-XNatif
EvolizEvolizCommerçants qui privilégient une facturation prête pour la comptabilité.À partir de 19 €/moisCompatible Factur-XNatif
ShineShineMicro-entreprises qui veulent un compte pro simple et la facturation.À partir de 8 €/moisCompatible Factur-XNatif
OdooOdooEntreprises en croissance qui veulent un ERP complet.Gratuit pour une app, puis à partir de 20 €/utilisateur/moisPrise en charge Factur-XNatif
DolibarrDolibarrEntreprises qui veulent une facturation gratuite et auto-hébergeable.Gratuit (auto-hébergé), cloud à partir de 12 €/moisFactur-X via modulesNatif
VosFacturesVosFacturesFacturation en ligne simple et multi-devises.Offre gratuite, payant à partir de 9 €/moisPrise en charge Factur-XNatif
ZohoZohoVendeurs internationaux qui veulent une suite globale.Zoho Invoice gratuit, Books à partir de 15 €/moisFacturation électronique selon les paysNatif
Outil par outil

Les logiciels de facturation que nous connectons

Chaque outil passé en revue pour les vendeurs en ligne.

Pennylane
Pennylane
Comptabilité + facturation
Plateforme tout-en-un de comptabilité et de facturation pensée avec les experts-comptables. Plébiscitée par les marques e-commerce françaises en croissance qui veulent comptabilité et facturation au même endroit.
Idéal pour: Marques en croissance qui veulent une comptabilité en temps réel et la facturation.
À partir de 29 €/moisCandidat PDP enregistré

Fonctionnalités clés

  • Comptabilité en temps réel synchronisée avec votre banque
  • Devis, factures et avoirs
  • Espace partagé avec votre expert-comptable

Points forts

  • Automatisation comptable poussée
  • Reporting et vue de trésorerie solides
  • Conçu pour la réforme de la facturation 2026

À garder en tête

  • Plus intéressant avec un expert-comptable
  • Plus complet qu’un indépendant n’en a besoin
Sellsy
Sellsy
CRM + facturation
Suite française combinant CRM, facturation et pré-comptabilité. Idéale quand le suivi commercial compte autant que la facturation.
Idéal pour: Marques qui ont besoin de CRM, devis et facturation dans un seul outil.
À partir de 29 €/utilisateur/moisCandidat PDP

Fonctionnalités clés

  • CRM et pipeline commercial
  • Facturation et relances automatisées
  • Exports de pré-comptabilité

Points forts

  • Unifie vente et facturation
  • Automatisation et relances puissantes
  • Évolue de la TPE au mid-market

À garder en tête

  • Le tarif par utilisateur s’additionne
  • Richesse fonctionnelle à prendre en main
Qonto
Qonto
Compte pro + facturation
Compte bancaire professionnel avec facturation intégrée. Émettez des factures et rapprochez les paiements depuis le même endroit que vos comptes.
Idéal pour: Fondateurs qui veulent banque et facturation réunies.
À partir de 9 €/moisCompatible Factur-X

Fonctionnalités clés

  • Compte pro avec cartes
  • Facturation et devis intégrés
  • Rapprochement automatique des paiements

Points forts

  • Banque + facturation dans une seule app
  • Ouverture rapide
  • Interface claire et moderne

À garder en tête

  • Facturation plus légère que les suites dédiées
  • Fonctions comptables limitées
Abby
Abby
Facturation pour indépendants
Conçu pour les auto-entrepreneurs et indépendants. Gère la facturation, les déclarations URSSAF et la comptabilité de base avec un minimum de configuration.
Idéal pour: Auto-entrepreneurs qui vendent en ligne.
Offre gratuite, Pro à partir de 11 €/moisCompatible Factur-X

Fonctionnalités clés

  • Factures et devis conformes
  • Assistant de déclaration URSSAF
  • Expérience mobile-first

Points forts

  • Offre gratuite pour démarrer
  • Adapté aux micro-entrepreneurs
  • Simple et rapide

À garder en tête

  • Pas conçu pour les grandes équipes
  • Multi-devises limité
Axonaut
Axonaut
CRM/ERP-léger tout-en-un
Outil de gestion tout-en-un pour les petites entreprises françaises : CRM, facturation, dépenses et suivi de projet dans un seul abonnement.
Idéal pour: Petites équipes qui veulent un seul outil pour tout.
À partir de 42 €/moisCompatible Factur-X

Fonctionnalités clés

  • CRM et facturation
  • Suivi des dépenses et de la trésorerie
  • Tarif forfaitaire par entreprise

Points forts

  • Large périmètre fonctionnel pour le prix
  • Un seul abonnement pour toute l’équipe
  • Support en français

À garder en tête

  • Interface dense
  • Moins spécialisé que les outils dédiés
Evoliz
Evoliz
Facturation + pré-comptabilité
Logiciel de facturation de qualité comptable, axé sur des documents propres et conformes et une transmission fluide vers votre expert-comptable.
Idéal pour: Commerçants qui privilégient une facturation prête pour la comptabilité.
À partir de 19 €/moisCompatible Factur-X

Fonctionnalités clés

  • Facturation et devis conformes
  • Rapprochement bancaire
  • Exports comptables (FEC)

Points forts

  • Forte cohérence comptable
  • Fiable et conforme
  • Bon rapport qualité-prix

À garder en tête

  • CRM plus léger
  • Moins d’intégrations que les grandes suites
Shine
Shine
Compte pro + facturation
Compte professionnel en ligne avec outils de facturation, destiné aux indépendants et très petites entreprises qui recherchent la simplicité.
Idéal pour: Micro-entreprises qui veulent un compte pro simple et la facturation.
À partir de 8 €/moisCompatible Factur-X

Fonctionnalités clés

  • Compte pro et cartes
  • Facturation et devis
  • Rappels administratifs (URSSAF, TVA)

Points forts

  • Très facile à utiliser
  • Banque + facturation réunies
  • Rappels administratifs utiles

À garder en tête

  • Limité pour les équipes qui grandissent
  • Fonctions comptables basiques
Odoo
Odoo
ERP complet
ERP open-source modulaire. La facturation n’est qu’une app parmi d’autres — stocks, CRM, comptabilité et plus — idéal quand vous dépassez les outils spécialisés.
Idéal pour: Entreprises en croissance qui veulent un ERP complet.
Gratuit pour une app, puis à partir de 20 €/utilisateur/moisPrise en charge Factur-X

Fonctionnalités clés

  • Apps modulaires (facturation, stocks, CRM…)
  • Open-source et personnalisable
  • Multi-sociétés et multi-devises

Points forts

  • Extrêmement flexible
  • Évolue avec des besoins complexes
  • Une seule plateforme pour toute l’entreprise

À garder en tête

  • Mise en place et personnalisation exigeantes
  • Peut être surdimensionné pour une petite boutique
Dolibarr
Dolibarr
ERP open-source
ERP et CRM open-source gratuit, en auto-hébergement ou dans le cloud. Un choix économique pour les entreprises à l’aise pour gérer leur propre stack.
Idéal pour: Entreprises qui veulent une facturation gratuite et auto-hébergeable.
Gratuit (auto-hébergé), cloud à partir de 12 €/moisFactur-X via modules

Fonctionnalités clés

  • Modules facturation, CRM et stocks
  • Auto-hébergé ou cloud
  • Grande communauté open-source

Points forts

  • Gratuit et open-source
  • Très personnalisable
  • Pas de dépendance fournisseur

À garder en tête

  • Nécessite une mise en place technique
  • Interface vieillissante
VosFactures
VosFactures
Facturation en ligne
Facturation en ligne simple pour indépendants et petites entreprises, avec prise en charge multi-devises et multilingue native.
Idéal pour: Facturation en ligne simple et multi-devises.
Offre gratuite, payant à partir de 9 €/moisPrise en charge Factur-X

Fonctionnalités clés

  • Factures, devis et estimations
  • Multi-devises et multilingue
  • Facturation récurrente

Points forts

  • Facile à prendre en main
  • Abordable
  • Adapté aux ventes transfrontalières

À garder en tête

  • Fonctions comptables limitées
  • Moins d’intégrations natives
Zoho
Zoho
Suite de facturation internationale
Au sein de l’écosystème Zoho, Zoho Invoice et Books proposent facturation et comptabilité avec une forte automatisation, prisés par les vendeurs internationaux.
Idéal pour: Vendeurs internationaux qui veulent une suite globale.
Zoho Invoice gratuit, Books à partir de 15 €/moisFacturation électronique selon les pays

Fonctionnalités clés

  • Facturation et comptabilité
  • Automatisation et workflows poussés
  • Intégré à la suite d’apps Zoho

Points forts

  • Offre gratuite généreuse (Invoice)
  • S’adapte à l’international
  • Connecté aux autres apps Zoho

À garder en tête

  • Moins spécifique à la France
  • Meilleur rapport qualité-prix dans l’écosystème Zoho
Comment choisir

Comment choisir le bon logiciel de facturation

Votre taille et votre statut
Auto-entrepreneurs, TPE/PME et marques en croissance ont des besoins très différents. Les indépendants privilégient la simplicité et une offre gratuite ; les marques en croissance ont besoin de profondeur comptable et d’accès en équipe.
Intégration comptable
Si vous travaillez avec un expert-comptable, un outil avec de bons exports — ou un accès partagé, comme Pennylane — fait gagner des heures à tout le monde chaque mois.
Conformité à la réforme 2026
La réforme française rend la facturation électronique et l’e-reporting obligatoires. Choisissez un outil qui se prépare en tant que PDP ou prend en charge Factur-X.
Connectivité e-commerce
Votre logiciel de facturation ne vaut que par sa connexion à votre boutique. Order Invoicer relie automatiquement vos canaux de vente à tous les outils de cette liste.
FAQ

Questions fréquentes

Les tarifs et le statut vis-à-vis de la réforme 2026 sont indicatifs et basés sur des informations publiques disponibles en 2026. Vérifiez les détails à jour auprès de chaque éditeur. Ceci ne constitue pas un conseil fiscal ou juridique.

Automatisez la facturation de votre boutique en ligne

Connectez votre boutique et votre logiciel de facturation en quelques minutes — factures et avoirs sont créés pour vous.